凈水器只能去除水中溶解的膠體、泥沙、鐵銹等體積較大的顆粒和雜質，對分子級的有害物則沒有任何效果。例如鈣鎂離子（碳酸鈣、硫酸鎂）、汞、鉛氟化物等。

所以嚴謹?shù)恼f直飲水（普通的市政管網的自來水）都能達到飲用水標準。而凈水機出來的水中的有害成分還是很多的，直飲機則不同，它其實是一個分子篩。能有效的濾除幾乎所有的有害物質，同時由于其采用的是納米級技術，通常只有小分子水（5—6個水分子組成的小分子團水）可以通過也就是“富氧水”這是普通凈水機不能做到的。此外由于逆滲透通常需要較高的滲透壓（0.5Mpa）以上，所以都需要增壓裝置（增壓泵）。